Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms