Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PNMA8BQ9ULN7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms