Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG2Q9UBF2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COPG2Q9UBF2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms