Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2S2

NRXN2, Neurexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN2Q9P2S2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NRXN2Q9P2S2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN2Q9P2S2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN2Q9P2S2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms