Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG1

PRTFDC1, Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTFDC1Q9NRG1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRTFDC1Q9NRG1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRTFDC1Q9NRG1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRTFDC1Q9NRG1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRTFDC1Q9NRG1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRTFDC1Q9NRG1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRTFDC1Q9NRG1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRTFDC1Q9NRG1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRTFDC1Q9NRG1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms