Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDT1Q9H211 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDT1Q9H211 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDT1Q9H211 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDT1Q9H211 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.6 ms