Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHMP4AQ9BY43 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHMP4AQ9BY43 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4AQ9BY43 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms