Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSG1Q9BU20 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms