Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD9AQ99638 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms