Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP30Q70CQ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP30Q70CQ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms