Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC30Q5VVM6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC30Q5VVM6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms