Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCTN1Q2MV58 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCTN1Q2MV58 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCTN1Q2MV58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCTN1Q2MV58 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms