Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB3Q12988 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HSPB3Q12988 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HSPB3Q12988 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HSPB3Q12988 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HSPB3Q12988 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HSPB3Q12988 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB3Q12988 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB3Q12988 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HSPB3Q12988 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB3Q12988 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HSPB3Q12988 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB3Q12988 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB3Q12988 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB3Q12988 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB3Q12988 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB3Q12988 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HSPB3Q12988 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HSPB3Q12988 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB3Q12988 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
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