Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms