Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIK1P57059 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIK1P57059 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIK1P57059 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIK1P57059 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SIK1P57059 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIK1P57059 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIK1P57059 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIK1P57059 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIK1P57059 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIK1P57059 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIK1P57059 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIK1P57059 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIK1P57059 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIK1P57059 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIK1P57059 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIK1P57059 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIK1P57059 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIK1P57059 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIK1P57059 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIK1P57059 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIK1P57059 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIK1P57059 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIK1P57059 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIK1P57059 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIK1P57059 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIK1P57059 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIK1P57059 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIK1P57059 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SIK1P57059 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIK1P57059 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIK1P57059 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIK1P57059 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIK1P57059 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIK1P57059 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIK1P57059 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIK1P57059 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIK1P57059 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIK1P57059 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIK1P57059 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SIK1P57059 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIK1P57059 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIK1P57059 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIK1P57059 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIK1P57059 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIK1P57059 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIK1P57059 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIK1P57059 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIK1P57059 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIK1P57059 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIK1P57059 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIK1P57059 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIK1P57059 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIK1P57059 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SIK1P57059 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIK1P57059 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIK1P57059 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIK1P57059 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIK1P57059 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIK1P57059 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIK1P57059 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIK1P57059 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIK1P57059 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIK1P57059 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIK1P57059 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIK1P57059 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIK1P57059 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIK1P57059 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIK1P57059 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIK1P57059 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIK1P57059 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIK1P57059 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SIK1P57059 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIK1P57059 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIK1P57059 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIK1P57059 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIK1P57059 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SIK1P57059 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SIK1P57059 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIK1P57059 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms