Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGAEP38570 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ITGAEP38570 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms