Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms