Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RLBP1P12271 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms