Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC2O95347 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC2O95347 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC2O95347 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC2O95347 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC2O95347 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC2O95347 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC2O95347 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC2O95347 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC2O95347 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC2O95347 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC2O95347 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC2O95347 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC2O95347 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC2O95347 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC2O95347 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC2O95347 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC2O95347 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC2O95347 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC2O95347 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC2O95347 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC2O95347 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC2O95347 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC2O95347 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC2O95347 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC2O95347 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC2O95347 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC2O95347 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC2O95347 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC2O95347 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMC2O95347 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMC2O95347 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC2O95347 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC2O95347 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC2O95347 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC2O95347 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC2O95347 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC2O95347 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC2O95347 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC2O95347 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC2O95347 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC2O95347 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC2O95347 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms