Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms