Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.79■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.78■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.78■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.77■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.76■■■■□ 3
FER1L4A9Z1Z3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FER1L4A9Z1Z3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FER1L4A9Z1Z3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms