Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQA8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQA8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQA8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQA8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQA8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQA8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQA8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U3KQA8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U3KQA8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQA8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQA8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQA8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQA8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQA8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQA8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQA8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQA8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQA8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQA8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQA8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQA8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQA8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQA8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQA8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQA8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQA8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQA8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQA8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQA8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQA8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQA8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQA8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQA8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQA8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQA8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQA8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQA8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
U3KQA8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQA8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQA8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQA8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQA8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQA8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQA8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQA8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQA8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQA8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQA8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQA8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQA8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQA8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
U3KQA8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQA8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQA8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
U3KQA8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQA8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQA8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQA8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQA8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQA8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms