Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SORCS3Q9UPU3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms