Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHA12Q9UN75 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms