Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL4Q9UM19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HPCAL4Q9UM19 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPCAL4Q9UM19 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPCAL4Q9UM19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPCAL4Q9UM19 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPCAL4Q9UM19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPCAL4Q9UM19 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPCAL4Q9UM19 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms