Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VPREB3Q9UKI3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms