Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
TNIKQ9UKE5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TNIKQ9UKE5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms