Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM7Q9UK45 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM7Q9UK45 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM7Q9UK45 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM7Q9UK45 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM7Q9UK45 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms