Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD3Q9UJU5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms