Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFDP1Q9UEE9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms