Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT2

UBA2, SUMO-activating enzyme subunit 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2Q9UBT2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA2Q9UBT2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA2Q9UBT2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms