Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DPM3Q9P2X0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DPM3Q9P2X0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms