Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD3Q9NX63 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD3Q9NX63 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms