Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNPLA3Q9NST1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms