Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A20Q9NP91 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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