Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms