Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM39BQ9GZU3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms