Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 331.1 ms