Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC3Q9BY71 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC3Q9BY71 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms