Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM42Q9BTD8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms