Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM29Q9BSF4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms