Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY1Q96T51 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms