Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP8Q96LD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms