Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPNS2Q96L46 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms