Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SIRT1Q96EB6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms