Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TSR2Q969E8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms