Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
TOPBP1Q92547 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TOPBP1Q92547 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms