Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC82Q8N4S0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms