Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A0

KRT222, Keratin-like protein KRT222, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT222Q8N1A0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT222Q8N1A0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT222Q8N1A0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT222Q8N1A0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms