Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SKAP1Q86WV1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms